序列特異性寡核苷酸探針聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)(PCR-sequence specific oligo—nucleotide probing,SSOP)的分析步驟是:先對(duì)SNP的多態(tài)區(qū)域進(jìn)行擴(kuò)增,在擴(kuò)增過程中對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行同位素或非同位素標(biāo)記,然后針對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物根據(jù)堿基配對(duì)原則設(shè)計(jì)系列寡核苷酸探針,并將其固定在膜上,最后將PCR嚴(yán)物與膜上的探針雜交、放射自顯影,根據(jù)信號(hào)判斷結(jié)果。PCR-SSOP分型技術(shù)是目前最常用、認(rèn)可度最高的DNA分型技術(shù)之一(Delahunty et a1.,1996)。PCR-SSOP技術(shù)具有靈敏度高、特異性強(qiáng)、需樣本量少的特點(diǎn),用于SNP分型主要包括正相SSOP方法和反相SSOP方法兩種。前者是將PCR產(chǎn)物固定在膜PCR用標(biāo)記的探針與之進(jìn)行雜交;后者是將特異性探針固定在膜上,用標(biāo)記的PCR產(chǎn)物與之雜交,目前廣泛采用的是反相SSOP方法。PCR-SSOP技術(shù)由于所用的載體大多為膜或微滴定板,對(duì)于復(fù)雜而眾多的SNP等位基因來說,它不具有集成化的優(yōu)點(diǎn),而且洗脫條件比較繁瑣,難以實(shí)現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)化和自動(dòng)化。
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